El nuevo complejo consta de siete edificios industriales de la década de 1910 (almacenes, laboratorios y tanques de fermentación) y tres nuevos edificios: el Museo (espacios para exposiciones temporales), el Cine (sala multimedia) y la Torre de 10 pisos (edificios para la exposición de la propia colección de la Fundación Prada (se abrirá un poco más tarde), así como un gran patio. Del área total de 18.900 m2, se han destinado 11.000 m2 para exposiciones.
Al describir su construcción, Rem Koolhaas señaló que la actual “increíble expansión del sistema artístico” no ha ido acompañada de un aumento en el número de tipos de edificios expositivos: hay muy pocos de ellos. El tipo más popular, que ha servido a sus naves industriales, es el que los artistas eligen como opción neutral "por defecto", que no entra en conflicto con sus obras.
A diferencia de muchos otros ejemplos similares, la planta de Prada en el distrito Largo Isarco de Milán exhibe un “repertorio” muy grande de formas y tipos de espacios, a menudo contrastantes: estrechos y amplios, claros y oscuros, abiertos y cerrados. Según Koolhaas, tal variedad de arquitectura desafiará al arte y contribuirá a la creación de proyectos originales.
Además, el arquitecto abordó el tema de la conservación del patrimonio, que todavía le interesa. Considera que su proyecto no es ni una "conservación", ni un edificio nuevo, sino algo intermedio. La interacción constante de estos dos "estados" no permitirá que partes de la estructura se fusionen en una sola imagen, o uno de sus componentes, para ganar supremacía sobre el resto.
En general, el complejo, a pesar de su cliente "lujoso", tiene una solución bastante modesta. Solo uno de los edificios, cubierto con dorado, llama la atención desde lejos (Koolhaas afirma que una solución de fachada de este tipo es más asequible que el mármol o incluso la pintura). Además, se utilizó espuma a base de aluminio para las fachadas e interiores.
Además del desarrollo del proyecto arquitectónico, OMA también actuó como los autores del diseño de la primera exposición en el complejo de Milán. Serial Classics (comisariada por Salvatore Settis) explora la controvertida relación entre la autenticidad y la imitación en la antigua Roma a través de las numerosas copias romanas de la escultura griega que pueden verse como un tributo a la cultura griega.
La entrada de la Fundación Prada tiene un restaurante diseñado por el cineasta Wes Anderson y un área infantil diseñada por estudiantes de la Escuela de Arquitectura de Versalles.