Los arquitectos austriacos ganaron un concurso para este proyecto en 2001, y su implementación no fue fácil: el proceso de construcción se interrumpió durante dos años, y su primera fase incluyó exclusivamente la construcción de una cimentación de pilotes (la longitud total de los pilotes hincados fue de 536 metro). Eran necesarios, ya que el museo se erigió en un suelo costero débil, en la confluencia del Ródano y Sona. Confluencia se traduce como "fusionar"; también es el nombre de toda el área adyacente a la "flecha" (punto de confluencia, "punto de confluencia").
El museo es un edificio importante a escala de ciudad: su ubicación destacada lo convierte en un "faro" y un símbolo de todo el nuevo distrito de Confluence, una antigua zona industrial-península cerca del centro de Lyon, que ahora se está construyendo con Instituciones, oficinas y edificios residenciales diseñados por destacados arquitectos.
El edificio Coop Himmelb (l) au está ubicado en rutas peatonales concurridas, por lo tanto, para no crear un obstáculo para el movimiento de los ciudadanos, el edificio se eleva sobre el suelo y debajo hay una "plaza" con un comedor..
El Museo Confluence consta de tres partes. El "zócalo", sobre el que se ubica la citada "plaza", alberga dos auditorios (para 327 y 122 plazas, respectivamente), locales para alumnos de escuelas cercanas, almacenes y talleres, salas de reuniones. Glazed Crystal es un vestíbulo con una rampa en espiral, escaleras y ascensores, y una librería. El tercer y más importante volumen es una "Nube" de acero inoxidable con una estructura de soporte como un puente. Hay 9 salas (4 para exposiciones permanentes y 5 para exposiciones temporales) y talleres "públicos"; el nivel superior alberga las oficinas de administración y la azotea alberga una cafetería y paneles solares. Los brazos voladizos "voladores" del edificio están inspirados en corrientes de agua que se fusionan una al lado de la otra.
El presupuesto del proyecto fue de 185 millones de euros (3980 euros por metro cuadrado).